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蛋白质组学和分子医学

玛格丽特Simonian

大卫格芬医学院,加州大学洛杉矶分校,美国

电子邮件:margaret@chem.ucla.edu

DOI: 10.15761 / IMM.1000233。

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分子医学在细胞和分子水平上促进对疾病的生物学机制的理解,以便更好地诊断、治疗和预防疾病。由于蛋白质、基因和疾病之间的联系,蛋白质组学在医学研究和分子医学,如药物发现和诊断等方面发挥着重要作用,被认为是现代生物学[1]的下一步发展方向。了解蛋白质的功能有助于了解疾病,目前大多数药物要么是蛋白质,要么是针对体内的特定蛋白质[2]。在临床蛋白质组学领域,识别与特定疾病相关的独特蛋白表达是一个非常重要和有前景的领域。神经蛋白质组学是脑疾病研究中的新兴应用。脑组织的蛋白质组学分析是神经科学研究的重要组成部分[3-5],尽管面临着许多挑战,最重要的是难以获得足够的样品进行质谱分析(MS),这需要至少30纳米的蛋白质。通常在样品制备过程中会丢失30 - 40%的蛋白质,因此(MS)并不总能检测到低丰度的蛋白质[6,7]。动物模型的可用性可能在某些情况下解决这些问题。

与基因组学相比,蛋白质组学是动态的,因为它不断变化以反映细胞的环境。蛋白质组学领域的主要目标是;识别所有的蛋白质,分析不同样品中不同的蛋白质表达,通过识别和研究它们的功能和细胞定位来确定蛋白质的特征,并了解蛋白质相互作用网络。

蛋白质组学的依赖;成功的蛋白质分离和纯化技术,质谱分析,生物信息学,基因和蛋白质数据库。在任何成功的蛋白质组学项目[8]中,样品制备是最关键和最具挑战性的任务。蛋白质的分离包括通过打破细胞壁释放蛋白质,并将蛋白质溶解在缓冲液中进行分离和分析。根据组织和细胞类型的不同,分离方法可以从简单的溶解到更复杂的提取。蛋白质的纯化方法和回收的困难是表征分析的主要障碍,特别是低丰度蛋白,如膜蛋白[10]。

定量标记和非标记蛋白质组技术有助于揭示疾病途径、生物标志物发现和药物开发的研究。这些技术的不断进步有望更快更好地分析蛋白质,了解它们在许多重要疾病中的功能和作用,如阿尔茨海默病、帕金森病和癌症。

参考文献

  1. 脑动静脉畸形(AVMs):原因、治疗与研究。MOJ蛋白质组学和生物信息学2: 5。
  2. 2.Wulfkuhle JD, Liotta A, Petricoin EF(2003)早期检测:蛋白质组学在癌症早期检测中的应用。Nat牧师癌症3: 267 - 75。[Crossref
  3. Simonian M, Molloy MP, Stoodley MA (2012)在体外在活的有机体内脑动血管病血管治疗中内皮细胞表面蛋白的生物素化研究Metabol J
  4. Simonian M, Loo RRO, Loo JA, Stoodley MA, Molloy MP(2014)蛋白质组学检测照射后内皮细胞表面蛋白作为脑动静脉畸形分子治疗的潜在靶点.MOJ普罗特Bioinf
  5. Barkhoudarian G, Whitelegge JP, Kelly DF, Simonian M(2016)脑膜瘤的蛋白质组学分析,寻找新的侵袭行为生物标志物。J Proteo Bioinfo9: 53-57。[Crossref
  6. Ball H, Roulhac L. Alzate O.(2010)神经蛋白组学中蛋白质分离的多维技术。Neuroproteomics。博卡拉顿(FL)第三章。[Crossref
  7. Butcher J(2007)神经蛋白质组学已经成熟。柳叶刀神经.6: 850
  8. Hall J, Morton I(1999)《药理学药剂简明词典:性质和同义词》。Kluwer学术255: 5521 - 4。
  9. Bodzon-Kulakowska A, Bierczynska-Krzysik A, Dylag T(2007)蛋白质组学研究中的样品制备方法。生物医学和生命科学中的色谱-分析技术。849:1-31。[Crossref
  10. Cañas B, Piñeiro C, Calvo E, López-Ferrer D, Gallardo JM(2007)经典和第二代蛋白质组学样品制备的趋势。J Chromatogr153: 235 - 58。[Crossref

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主编

伊凡痛风
伦敦大学学院

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出版的历史

收稿日期:2016-07-27
录用日期:2016年8月5日
出版日期:2016年8月9日

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©2016 Simonian M.这是一篇开放获取的文章,在知识共享署名许可协议的条款下发布,该协议允许在任何媒体上无限制地使用、发布和复制,前提是注明原作者和来源。

引用

王志强(2016)蛋白质组学与分子医学。Integr Mol Med 3: DOI: 10.15761/IMM.1000233。

相应的作者

玛格丽特Simonian

加州大学洛杉矶分校David Geffen医学院,611 Charles E. Young Drive East, CA. 90095, USA, Tel: +(1) 310-794-7308, Mobile +(1) 310-893-4593

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