目的
目的对成人特应性皮炎(AD)患者rs7927891基因多态性进行表型-基因型关联分析。
材料和方法
最终,90例患者被纳入研究,其中男性31例(30±10岁),女性59例(31±11岁)。在他们当中,65%的男性和75%的女性报告有阳性的特应性表型家族史。
结果
在多态性rs792894中,我们没有观察到AD男性和女性之间的基因型分布和/或等位基因频率的显著差异。但11q13.5染色体上rs7927894多态性的CT基因型在总IgE高于158iu /ml的AD女性中出现的频率要高出4倍以上。在AD男性中,11q13.5染色体rs7927894多态性与特应性表型/易感性显著相关:CC和TT基因型在具有其他特应性表型(哮喘、特应性鼻炎)的AD男性中出现的频率是无特应性表型的AD男性的6倍。特应性表型阳性家族史男性的TT基因型多4倍。
结论
我们在AD患者的rs7927894多态性中确定了一些AD表型的重要危险基因型,在成年AD男性和女性中不同。
特应性皮炎,基因多态性,基因型-表型研究,rs7927891
特应性皮炎(AD),或称湿疹,是最常见的慢性炎症性皮肤病之一,儿童患病率高达20%,成人患病率为3%。它通常始于婴儿期,经常先于或同时发生哮喘和鼻炎。它的特点是皮肤干燥,强烈瘙痒,典型的与年龄相关的炎性病变分布,频繁的细菌和病毒重复感染。皮肤屏障功能的深刻改变和免疫异常被认为是影响AD发展和严重程度的关键因素,但确切的细胞和分子机制仍不完全清楚。
特应性皮炎(AD)遗传率高。除了聚丝蛋白(焦距),影响AD的基因在很大程度上是未知的。一个关联信号最近在11q13.5 (rs7927894),下游C11orf3[2 - 4]。多态性rs7927894位于基因间区下游38 kbC11orf30(染色体11开放阅读框30)上游68kbLRRC32(富亮氨酸重复含32)。C11orf30和LRRC32普遍表达,包括与特应性皮炎相关的组织,如皮肤和外周血单个核细胞。潜在的参与C11orf30在多种炎症性和恶性上皮疾病(特应性皮炎、克罗恩病和腺癌)中强烈提示C11orf30在上皮免疫、生长和/或分化方面,[3]大约13%的欧洲血统的个体rs7927894 [T]是纯合子,他们发生特应性皮炎的风险是[5]非携带者的1.47倍。
在本研究中,我们对90名成人特应性皮炎患者进行了染色体11q13.5上rs7927894单核苷酸多态性的基因型-表型研究
病人
共90例AD患者,1圣圣安学院布尔诺医院的皮肤科被招募到这项研究中。患者根据公认标准Hanifin和Rajka[6]进行诊断。
人口统计数据见表1和表2。男性和女性之间的表型差异(M/W)不显著。
表1。描述性特征-个人经历
男/女(N=90) |
32% / 68% |
年龄男/女(岁) |
30±10/ 31±11 |
特应性表型M/W的个人史 |
65% / 47% |
个人航空过敏史 |
90% / 73% |
个人食物过敏史 |
29% / 41% |
其他复杂疾病(非特应性)病史 |
23% / 39% |
个人糖尿病史 |
0% / 5% |
个人心血管病史 |
11% / 18% |
个人GIT病史M/W |
8% / 12% |
个人甲状腺病史 |
0% / 7% |
米/ W -男人/女人
表2。描述性特征-家族史
遗传性M/W家族病史 |
65% / 75% |
非特应性疾病家族史 |
71% / 80% |
银屑病家族史M/W |
3% / 19% |
甲状腺病家族史M/W |
10% / 45% |
糖尿病家族史M/W |
53/59% |
癌症家族史M/W |
36% / 60% |
心血管疾病家族史 |
36% / 66% |
米/ W -男人/女人
采用常规PCR结合限制性内切酶分析对所有患者进行rs7927894基因分型。
这项研究得到了布尔诺马萨里克大学医学院人类受试者医学实验伦理委员会的批准。64/93, 1993),并按照《赫尔辛基准则宣言》执行。参与者给出了书面知情同意,并已存档。
基因分型
采用PCR和限制性内切分析进行基因分型。
采用苯酚-氯仿提取和细胞蛋白酶K消化的标准方法从外周血白细胞中纯化基因组DNA。
采用PCR反应(引物5´- TGT TAA GAA TCC CCA CCT CAC T-3´和5´- gcc TCA GTT TCC TCA TGG TAA G-3´),并用HINFI限制性内切酶分析rs7927894染色体11q13.5多态性的基因型。基因型分别为CT (9, 85, 106 182/9, 85, 288 bp)、CC (9, 85, 106 182/9, 85, 106 182 bp)和TT (9, 85, 288/9, 85, 288 bp)。
采用2%琼脂糖Serva电泳检测基因型。
统计数据
使用STATISTICA软件(StatSoft, version 11)进行统计分析。所有分类资料采用单尾Fisher精确检验,连续资料采用Mann-Whitney u检验和Kruskall-Wallis检验。尝试了四种不同的遗传模式:基于等位基因的加性遗传模式(一个等位基因vs另一个等位基因)、基于基因型的显性遗传模式(更常见的纯合子vs更罕见的等位基因携带者)、共显性/隐性遗传模式(更罕见的纯合子vs常见的等位基因携带者)和过度显性遗传模式(均为纯合子vs杂合子)。
在检测到的多态性中,我们没有观察到男性和女性之间的基因型分布和/或等位基因频率的显著差异(数据未提供)。
当对AD男性和女性进行评估时,没有发现显著的基因型/表型关联。
将患者分组为男性和女性后,观察到一些差异:在AD女性中,11q13.5染色体rs7927894多态性的CT基因型在IgE水平升高的AD女性中更常见(OR=4.76, 95% CI 1.19-18.98, P=0.02,表3)。在AD女性中,我们发现11q13.5染色体rs7927894多态性与特应性表型显著相关:具有其他特应表型的AD男性CC和TT基因型的发生率是无特应表型的AD男性的6倍(OR=6.22, 95% CI 1.212-31.938, P=0.03)。同时,特应表型家族史阳性的AD男性中TT基因型的频率增加了4倍(OR=4.286, 95% CI 0.444-41.364, P=0.05,表4)。
表3。AD女性的rs7927894 (11q13.5)基因型和IgE水平
rs7927894 (11 q13.5) |
IgE无升高(< 158iu /ml) |
IgE升高(v³v158iu /ml) |
行 总数 |
CC |
11 (61%) |
17 (41%) |
28 |
CT |
3 (17%) |
20 (49%) |
23 |
TT |
4 (22%) |
4 (10%) |
8 |
所有毛评点 |
18 |
41 |
59 |
表4。rs7927894 (11q13.5)基因型与AD男性特异反应家族史
rs7927894 (11 q13.5) |
有特异反应性家族史 |
没有特异反应性家族史 |
行 总数 |
CC |
7 (35%) |
4 (36%) |
11 |
CT |
7 (35%) |
7 (64%) |
14 |
TT |
6 (30%) |
0 (0%) |
6 |
所有毛评点 |
20. |
11 |
|
除了焦距,两项针对特应性皮炎的欧洲GWAS建立了四个易感位点(C11orf30,OVOL1,ACTL9,RAD50 /使用IL13 / KIF3A)[2 - 3]。单核苷酸多态性rs7927894似乎标志着一个真正的湿疹易感性位点[7]。最近,研究发现C11orf30-rs2155219多态性使多敏化(特异性IgE/4变应原)[8]的风险增加一倍。
根据我们的研究,rs7927894的TT基因型在有特应性表型阳性家族史的AD患者中发生率为4倍,但仅在男性中。奥地利的一项研究表明,染色体11q13.5上的rs7927894变异与特应性皮炎有显著关联。但是,基因型-表型研究分析显示,rs7927894与疾病的早期发病年龄、伴发哮喘和变应性鼻结膜炎、血清总IgE水平和特应性[9]家族史没有显著相关性,这与我们的结果不一致。本研究对AD男性和女性数据进行严格分离的统计分析可能会导致不同的结果。
在其他QWAS研究中也发现了其他多态位点[10-11],可能很多位点存在连锁不平衡,并存在种群间差异。
我们在AD患者的rs7927894多态性中确定了一些AD表型的重要危险基因型,在成年AD男性和女性中不同。
这份出版物是在马萨里克大学作为项目“Experimentální molekulární patofyziologie vybraných komplexních chorob/ stavů”、MUNI/A/1549/2014和该项目的一部分撰写的”Faktory ovlivňující průběh a léčbu u chronických a závažných kožních diagnóz”,MUNI/ a /1557/2014得到捷克共和国教育、青年和体育部2015年提供的大学专项研究基金的支持。
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