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海星中的t细胞免疫调节蛋白阿斯忒瑞亚鲁本斯:基因组研究

米歇尔·勒克莱尔

556 rue Isabelle romsamade, 45640 Sandillon,法国

电子邮件:mleclerc45@gmail.com

DOI: 10.15761 / CRT.1000132

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摘要

海星的转录组阿斯忒瑞亚鲁本斯与小鼠基因组相比显示出t细胞免疫调节基因。该基因在哺乳动物和海星系统的移植物抗宿主反应中起调控作用。

关键字

t细胞免疫调节蛋白,海星,基因组

介绍

在哺乳动物中,t细胞免疫调节蛋白是t细胞功能的调节剂。在移植物抗宿主病模型中具有保护作用[1]。我们在过去已经证明了T和B海星淋巴细胞的存在[2]。在本文中,我们试图确定与海星T淋巴细胞结合的蛋白,作为T细胞免疫调节蛋白(TIP)。

材料与方法

海星来自瑞典哥德堡大学。

免疫、基因组研究已经有了描述[3]。

连接Illumina GSII测序系统的适配器后,在Illumina GSII平台上对cDNA进行测序,从约200 bp的片段的一侧测序1.100 bp

使用Velvet对序列进行组装[4]。

结果

T细胞免疫调节蛋白存在于免疫和非免疫的HRP海星基因组中。

免疫动物实验结果:

其中一个contig (Contig11337|m.9741)可以通过BLASTX进行注释亩骶来自Swissprot数据库(TIP_MOUSE)的“t细胞免疫调节蛋白OS = Mus musculus”,e值为2.35e-19。在113个氨基酸的排列区域中,发现74个阳性氨基酸和54个相同的氨基酸。
5 'TGCAACTTCCTTACATCATCCTGGGTCTTGGTCCAAATCCAAACTACGTTGATTCTTTAA
CAGTGAGCATTGCAGGCGCAACAAAACGAGACACACCGAACACAAGACAGCACACTTGGA
TGTCGATCATCCCAAACTCAGAGCTGATAGCAATTCCATATCCCCCTGACGAACCGGAGG
AGTGGACGAGTGTCCTGTTAATTACCCCTGGTAGATCCGTTCTATTGACCGGTGGCGTTC
TTATAGGAACCTGTGTATTTATGGCAATCGTAGTTGGCGTACTCCAACTTCTAGAAAAGA
GGGAAGATGATCGAGAAAAGAGACAGGAGTCTCACCGATTC3 '

讨论与结论

未免疫过HRP的海星也得到了类似的结果。

值得注意的是,T海星淋巴细胞在脊椎动物中诱导移植物抗宿主[2]。

当使用海星T细胞悬液注射时,可诱导鸡脾肿大和辐照小鼠血管生成。在不同浓度的t细胞免疫调节蛋白存在的情况下进行这些实验,并观察这种蛋白对鸡和辐照小鼠的影响(是否有抑制作用),这将是一件有趣的事情。

海星基因组中t细胞免疫调节蛋白的出现似乎是Asterids生理学的基础,并构成了这些最后的“生物标记”。

参考文献

  1. fisella M, Perry JW, Teng B,Bloom M, Zhang C,等。(2003)使用高通量筛选鉴定的t细胞因子TIP可提高移植物抗宿主病模型的存活率。自然生物技术21日:302 - 307。(Crossref
  2. 陈晓明,陈晓明,陈晓明,等(2012)海星igkappa基因的克隆与表达。Amer J immuno18: 191 - 195。(Crossref
  3. 版权所有OAT。海星:阿斯特里亚斯·鲁本斯(棘皮动物)Immunol列托人15: 68 - 70。
  4. Zerbino DR, Birney E, et . (2007) Velvet:使用de Bruijn图的从头短读汇编算法。创Res18: 821 - 829。(Crossref

编辑信息

主编

Jalal K. Ghali
美世大学

文章类型

简短的沟通

出版的历史

收稿日期:2016年4月2日
录用日期:2016年4月22日
出版日期:2016年4月25日

版权

©2016 Leclerc M.这是一篇根据知识共享署名许可协议发布的开放获取文章,该协议允许在任何媒体上不受限制地使用、分发和复制,前提是要注明原作者和来源。

引用

勒克莱尔M(2016)。海星中t细胞免疫调节蛋白:基因组研究。临床试验2:doi: 10.15761/CRT.1000132

相应的作者

米歇尔·勒克莱尔

556 rue Isabelle romsamade, 45640 Sandillon,法国。

电子邮件:mleclerc45@gmail.com

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