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简短的沟通
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收稿日期:2020年3月9日
录用日期:2020年3月17日
发布日期:2020年3月20日
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©2020 Pieczenik G.这是一篇根据知识共享署名许可条款发布的开放获取文章,在注明原作者和来源的情况下,允许在任何媒体上不受限制地使用、分发和复制。
引用
(2020)新型冠状病毒病DNA疫苗快速制备与治疗策略——第三部分。3号医疗病例代表。DOI: 10.15761 / MCRR.1000145
罗格斯大学环境与生物科学学院,美国新泽西州新不伦瑞克08901
DOI: 10.15761 / MCRR.1000145
在我们上一篇关于快速制备covid - 19疫苗和治疗疾病的论文的第2部分中,我们定义了三种可能的表位序列[1]。这三个表位序列是由我们开发的木村肽分析确定的,以确定这些序列的选择是在氨基酸序列上,而不是在核苷酸序列上。这证明了这些氨基酸序列对病毒存活的重要性,无论是结合还是功能尚待确定。这些序列也在病毒表面,因为它们与SARS表位相同的氨基酸序列已被鉴定出来,并可被抗体结合。
在这篇论文中,我们用这三个氨基酸序列创建了一个DNA序列,可以为这三个序列编码,一个独特的特征是要使用的密码子不是病毒使用的密码子,而是人类编码最常用的密码子。这些最常用的人类密码子是由GenScripts算法识别出来的,列于下表1:
表1。GenScript密码子使用频率表
人类aa |
最常用的人类密码子/aa |
F |
TTC,到达目标时间 |
l |
CTG |
Y |
TAC |
H |
CAC |
问 |
CAG |
我 |
空中交通管制 |
米 |
ATG |
N |
AAC格式 |
K |
亚美大陆煤层气有限公司 |
V |
GTG |
D |
广汽 |
E |
呕吐 |
年代 |
AGC,移行细胞癌 |
C |
TGC |
TRM |
矫正性大动脉转位 |
W |
TGG |
P |
CCA,有条件现金转移支付 |
R |
gg, AGA |
T |
ACC |
一个 |
甘氨胆酸GCC, |
G |
GGC |
G |
GGC |
利用这些密码子,我们可以反译这些论文第2部分中鉴定的三个表位序列。Dr.Z.Hu的回译使用了GenScript算法。
这些序列通过KpnI和NotI插入到pcNDA3.1(+)中,在它们前面有一个CMV启动子,创建一个人类DNA疫苗,可以复制其产物(GenScript)。这种表达表位肽的载体将在患者体内产生两种抗体,阻止covid - 19的结合并在细胞内与covid - 19竞争,制造这种载体的总成本为240美元(包括运输费用)(GenScript, Dr. Z.Hu pers.com)。这些DNA免疫载体可以很容易地作为肠道微生物传递[2]。这值得立即进行测试。
图1显示了添加终止密码子(tga)和Kozak起始序列(gccgccacc)的反向翻译[3]。
图1所示。冠状抗原表位DNA疫苗
这些DNA序列将被转录并翻译成表位氨基酸序列,从而诱导抗covid - 19抗体。此外,这些氨基酸序列将竞争性地结合并阻断covid - 19存活所需的位点。因此,这些序列可以直接用作DNA疫苗[4]。
此外,这些DNA序列也可以通过CRISPR和转座子技术插入[5],作为阻断肽和抗原肽的连续来源。在某种程度上,形成的抗新冠病毒抗体和形成的阻断肽数量将达到平衡。此时,疾病将得到治疗,传染性将受到抑制。这些DNA序列将与covid - 19病毒竞争双方所需的序列,并将限制covid - 19在没有这种基因型竞争的情况下最大限度地表达的能力[6]。
简短的沟通
收稿日期:2020年3月9日
录用日期:2020年3月17日
发布日期:2020年3月20日
©2020 Pieczenik G.这是一篇根据知识共享署名许可条款发布的开放获取文章,在注明原作者和来源的情况下,允许在任何媒体上不受限制地使用、分发和复制。
(2020)新型冠状病毒病DNA疫苗快速制备与治疗策略——第三部分。3号医疗病例代表。DOI: 10.15761 / MCRR.1000145
图1所示。冠状抗原表位DNA疫苗
表1。GenScript密码子使用频率表
人类aa |
最常用的人类密码子/aa |
F |
TTC,到达目标时间 |
l |
CTG |
Y |
TAC |
H |
CAC |
问 |
CAG |
我 |
空中交通管制 |
米 |
ATG |
N |
AAC格式 |
K |
亚美大陆煤层气有限公司 |
V |
GTG |
D |
广汽 |
E |
呕吐 |
年代 |
AGC,移行细胞癌 |
C |
TGC |
TRM |
矫正性大动脉转位 |
W |
TGG |
P |
CCA,有条件现金转移支付 |
R |
gg, AGA |
T |
ACC |
一个 |
甘氨胆酸GCC, |
G |
GGC |
G |
GGC |