“严重急性呼吸综合征冠状病毒2”(SARS-COV-2)是一种包膜,单链,正感RNA病毒,其负责高度传染性感染,称为“冠状病毒疾病19”(Covid-19)。SARS-COV-2被发现于2019年12月底。然后,它已经从中华人民共和国湖北省武汉蔓延到全球众多国家,并导致全球大流行[1]。
2020年8月最初在英国发现的一种新型SARS-CoV-2变种,B.1.1.7,已迅速超过全球其他毒株[2]。来自葡萄牙的科学家使用了Applied Bio-Systems TaqPath COVID-19 RT-PCR试剂盒,能够检测s基因靶点。然后,他们进行了验证性测试;他们发现,91.9%的S基因失败(SGTF)病例是B.1.1.7的变体。因此,他们得出结论,s基因靶标失败(SGTF)可能是B.1.1.7[3]的敏感替代品。
据估计,这种新的变异株SGTF的传染性比以前的变异株[4]高40% - 80%,比野生型[5]高35%。这种变体的传播导致英国COVID-19病例和死亡人数激增。此外,在其他国家,b1.1.7的生殖数量相对其他谱系较高;丹麦55%,瑞士74%,美国59% [5]
为了检测缅甸仰光的尖峰基因靶位失败(SGTF)的扩散,我们在2021年1月至5月2011年以来,在临床疑似案件,联系人和旅行者之间追踪了SGTF流行。这些样品主要用鼻咽拭子收集。然后,通过使用SARS COV-2 RT-PCR检测试剂盒筛选它们。之后,所有SARS COV-2阳性样品都用“TAQPATH-1步骤SARS COV-2检测试剂盒,Thermofisher Scientific”测试。SGTF被鉴定为“对N基因和ORF1ab基因靶标测试正(循环阈值小于37)的样品中的样品中的S基因靶标”(图1)。
图1。穗基因靶失败,根据(1)DSGH
在此期间,在76952个鼻咽拭子中测试,623个样品是SARS COV-2试验阳性。1月,2月,3月,4月,4月和5月份的正样品总数分别为316,115,88,56和48。在这些623个阳性样品中,发现17个样品(2.7%)有超过五个月的SGTF。虽然自202年1月以来,我们一直在尝试追踪SGTF,但在2021年3月之前没有检测到。我们仅在4月初而且仅在进口案件中发现了SGTF,只有旅行者。这些进口案件来自邻近的东盟国家;8来自印度,2来自泰国和韩国7例。4月份SARS COV-2对SARS COV-2的SGTF的阳性率为11%(6/56);它在5月份变得如下:23%(11/48)。因此,SGTF病例的趋势也在增加和惊人。
与英国的情况相反;随着新变异SGTF的发现,SARS冠状病毒阳性病例数量的突然激增和死亡率的增加,缅甸有不同的情况。虽然我们的研究是在军队医院进行的,但根据卫生和体育部统计的SARS Co V-2阳性确诊病例数如下:3月538例,4月383例,5月812例。此外,COVID-19严重感染死亡病例数如下;3月7例,4月3例,5月8例。很明显,4月份新增病例和死亡病例均有所下降,5月份再次上升;与SGTF阳性检出率趋势一致。虽然我们在缅甸入境口岸进行了早期发现和及时隔离,但新增病例和死亡病例的增加可能是由于SARS CoV-2- SGTF突变导致的快速传播。
这项研究有几个局限性。测序技术并不便宜,并不是所有的分子实验室都可以使用;此外,缅甸用于检测新变种SARS CoV-2的试剂价格昂贵。虽然这些数据只是一个地区的样本,但它突出了所有保健人员和公众的认识,特别是在缅甸入境点的筛查。
- 关华,梁wh,赵y,梁力,陈血管,等。(2020)合并症及其对1590例Covid-19患者的影响:全国范围内分析。欧元和J55:2000547. [十字架]
- 棕色ka,gubbay j,霍普金斯j,patel s,buchan sa等。(2021)COVID-19位于加拿大大多伦多地区的Covid-19孤立中的S-Gene目标失败和英国变异B.1.1.7的快速上升。MedRxiv。
- Borges v,Sousa C,Menezes L,Gonçalvesam,picãom等。(2021)跟踪SARS-COV-2谱系B.1.1.7传播:来自全国范围的尖峰基因靶衰竭(SGTF)和穗基因的洞察,葡萄牙,葡萄牙,第49周2020至第3周3 2021。ECDC26日:2100131。
- 英国SARS-CoV-2系B.1.1.7的传播:从流行病学和遗传数据的联系中获得的见解。MedRxiv
- Davies Ng,Abbott S,Barnard RC,Jarvis CI,Kucharski Aj,等。(2021)估计SARS-COV-2谱系B.1.1.7在英格兰的估计变速能率和影响。科学,纽约。第372:372:6538。
编辑信息
主编辑
彰Sugawara
日本东北大学医学院
文章类型
信编辑器
出版历史
收稿日期:2021年6月10日
接受日期:2021年6月25日
公布日期:2021年6月28日
版权
©2021 Pyar KP。这是一篇开放获取的文章,在知识共享署名许可协议的条款下发布,该协议允许在任何媒体上无限制地使用、发布和复制,前提是注明原作者和来源。
引用
Pyar KP,Wunna K,Su Kk,Tun Km,Min WKK等人。(2021)在NA(1)DSGH中的SARS COV-2阳性病例中,检测尖峰基因靶衰竭作为变异B 1.1.7的标志物。Clin Res试验7:DOI:10.15761 / CRT.1000347
相应的作者
Khin Phyu Pyar.
缅甸国防军医学院医学/肾脏学教授和主任。
电子邮件 :bhuvaneswari.bibleraaj@uhsm.nhs.uk.