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基于LIMD2差异表达的甲状腺癌转移的新生物技术机会

Rodrigo Pinheiro Araldi

巴西圣保罗联邦大学形态学系遗传学部甲状腺肿瘤实验室遗传基础

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Janete Maria Cerutti

巴西圣保罗联邦大学形态学系遗传学部甲状腺肿瘤实验室遗传基础

DOI: 10.15761 / TCRC.1000108

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摘要

甲状腺癌是全球最常见的内分泌相关癌症。虽然甲状腺癌被认为是一种相对罕见的疾病,但在过去几十年里,甲状腺癌的新病例数量比其他恶性肿瘤增长得更快。虽然70-80%的登记病例包括乳头状甲状腺癌和滤泡性甲状腺癌,其5年生存率高达98%,但近30%的患者有复发病史,10%的患者分化为最严重的疾病形式:低分化和间变性甲状腺癌(已知的最致命的癌症)。因此,了解上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)的分子机制对于在转移形成之前识别播散的癌细胞,以及为有复发和/或转移病史的患者提出最有效的治疗方法是必要的。在这种情况下,LIMD2作为一个有用的生物技术靶标出现,因为基因(LIMD2)在原发肿瘤和PTC转移中有差异表达。因此,研究LIMD2在EMT中的生物学特性可以为诊断和治疗领域带来新的机遇。

关键字

甲状腺癌,转移,上皮-间质转化,LIM结构域,LIMD2

甲状腺癌

甲状腺癌是内分泌相关癌症中最常见的类型[1,2]。虽然被认为是一种罕见疾病,但在过去的几十年里,该病的发病率一直在惊人地增长,特别是在意大利[3]、法国、以色列、澳大利亚[4]、韩国[5,6]和美国,这些国家的发病率增长了三倍以上[5,7-10]。根据美国国家癌症研究所(NCI)的数据,2018年美国预计将有53990例甲状腺癌新病例(https://seer.cancer.gov/statfacts/html/thyro.html)。甲状腺癌的平均年发病率在男性(5.4%)和女性(6.5%)中都在急剧上升。2020年和2030年发病率预测显示,到2030年,甲状腺癌的发病率将超过结直肠癌,并将成为2030年女性的主要癌症部位[11]。

在巴西,女性甲状腺癌的新病例数估计为每年每10万名女性8.040例,是女性中第五大最常见的癌症(http://www.inca.gov.br)。

尽管发病率不断上升,但甲状腺癌的死亡率保持稳定。然而,目前的研究显示,1973-2013年美国甲状腺癌相关发病率和死亡率均有所增加[12-14]。结合这些数据,作者根据肿瘤大小、分期、诊断时的组织学来评估甲状腺癌发病率死亡率。作者指出,晚期肿瘤的发病率和死亡率也有所增加,这表明该疾病的发病率确实增加,而不仅仅是过度诊断的结果[5,15]。

大多数原发性甲状腺癌起源于甲状腺滤泡细胞[16],包括分化型(乳头状和滤泡型甲状腺癌)、低分化型甲状腺癌(PDTC)和未分化或间变性甲状腺癌(ATC)[16,17]。甲状腺乳头状癌(PTC)几乎占所有甲状腺癌病例的大多数(80-90%),其次是滤泡性甲状腺癌(FTC)(5-10%)。甲状腺髓样癌(MTC)是一种罕见的起源于滤泡旁细胞的疾病(2%)[16,17]。

与大多数类型的癌症一样,甲状腺癌与多种基因的影响有关,通常还与生活方式和环境因素有关。PTC的危险因素包括甲状腺疾病或甲状腺癌的家族病史、遗传性疾病、辐射暴露和性别,FTC的危险因素包括低碘饮食和家族条件[18,19-21]。

直到20世纪90年代,据估计25%的甲状腺癌与突变[22]有关。由于大多数甲状腺癌的临床表现为惰性,因此期望肿瘤具有稳定的基因组和低突变负担。2014年,通过国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium)的the Cancer Genome Atlas (TCGA)对近500个PTC进行了基因组分析,大多数PTC的遗传格局被阐明,这一比例增加到90%[23,24]。虽然多个已知基因与PTC的发病机制相关,但作者证实,甲状腺癌是一种基因安静的疾病,每种癌症的突变数量相对较低。已知激活MAPK的基因(即Braf, ras, ret / ptcNTRK)和PI3K/AKT/mTOR(即信号通路PAX8/PPARG, PTEN)[25]。作者还描述了新基因的反复突变(EIF1AX)或者旧癌基因的新融合(RET, BRAFNRTK1/3碱性,FGFR2),以及22q的拷贝号变更[26,17,26-31]。TCGA数据也证实了端粒酶逆转录酶基因启动子区存在体细胞点突变()占PTC的9%。肿瘤与BRAFV600E突变与高复发风险、甲状腺分化丧失及放射碘亲和性丧失以及较高的死亡风险相关。

由于TCGA数据还显示BRAF和RAS突变的PTC表现出互斥的表达模式,作者开发了BRAFV600E - RAS评分,称为BRS。其余所有样品均采用BRS分级,根据RAS (RAS -like)或BRAF生物学特征进行分类V600E(BRAFV600E式)。此外,利用16个甲状腺相关基因的表达,建立甲状腺分化评分(TDS)来衡量甲状腺特异性分化。融合PAX8PPARG基因和突变在FTC中很常见。

目前甲状腺癌的治疗包括确定复发风险,以便制定治疗方案。到目前为止,还没有可靠的临床、病理或分子标记物可以区分哪些甲状腺癌患者需要积极监测,哪些患者会进展并发展为临床重大疾病,因此应该进行手术(肺叶切除术)vs甲状腺全切除术),其次是放射性碘治疗和抑制治疗。

此外,尽管大多数病例对常规治疗有满意的反应,但有一部分DTC、PDTC和ATC对标准治疗是难治的[17]。此外,约10%的DTC进展为PDTC或ATC[32],由于转移潜力,预后较差。

为了开发针对rai难治性甲状腺癌的新治疗策略,使用在信号转导通路水平(即RAS、BRAF/MEK/ERK、RET/PTC和VEGF受体)作用的酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)进行了临床前和临床研究。其中一些TKIs可能恢复碘摄取和对RAI的临床反应(请参阅最近的综述),

尽管TKIs的使用取得了进展,它对特定的基因突变有效,但转移仍然是成功治疗的障碍,因为可能发生靶基因的二次突变和替代途径的激活。除了这些耐药机制外,大多数与转移过程相关的基因尚不清楚,表型转化(上皮-间充质转化)可能是耐药的另一机制。

事实上,一些研究表明,癌症转移和药物耐药都与一个被称为上皮-间充质转化(EMT)的复杂病理过程有关。这一过程涉及遗传学、生化和形态学上的失调,导致上皮标记物下调和间充质标记物上调,这是信号分子和转录因子[33]异常激活的结果。这些变化导致杂交表型(上皮-间充质)的获得,表现为细胞极性的丧失和肌酸纤维的解聚,导致成纤维细胞形态的获得。

EMT期间验证的基因重编程不仅导致癌细胞扩散,而且由于能量代谢失调[34],有助于癌干细胞(CSC)表型的获得。

因此,识别转移过程中差异表达或突变的基因对于新的治疗策略至关重要。此外,它也可以帮助诊断循环癌细胞(液体活检)。

LIMD2:诊断和免疫治疗的生物技术靶点

在几个与甲状腺癌相关的基因中,LIMD2一旦在转移过程中有差异表达,就在不同肿瘤亚型(包括甲状腺)中占据显著位置,并调节细胞运动和肿瘤进展[35-37]。

基因LIMD2轨迹17q23.3)编码了一个小的连接蛋白(LIMD2 - LIM结构域含2),能够调节不同的生物过程,包括细胞运动[36]。的七种剪接变体LIMD2描述(表1)。

表1。LIMD2剪接变体。LIMD2变体的氨基酸序列,以粗体显示抗原序列(GFGRKQHKELWAHKEVDPGTKT)。来源:Protein Atlas。

变体

UniProt

大小

重量

序列

limd2 - 001

Q9BT23

127 aa

14070 kDa

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78 aa

9028 kDa

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12013 kDa

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limd2 - 010

J3KRR0

87 aa

9518 kDa

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由于LIMD2能够结合无法自我结合的蛋白质(适配器)[35],LIMD2是一种有用的候选靶点,用于对抗甲状腺癌的新疗法。

虽然Faooji已经破解了人类LIMD2蛋白的三维结构,.利用核磁共振(NMR,可在https://www.ebi.ac.uk/pdbe/entry/pdb/2LZU),关于其生物功能的信息很少。

根据剪接变体(表1),LIMD2蛋白有127个氨基酸,分子量在9.028 - 14.040 kDa之间,属于LIM结构域超类[36,38,39]。

LIM结构域在大约30年前被发现,是一种进化上几乎保守的锌指基序,存在于植物、真菌、变形虫和动物,包括人类[38,40]。该结构域由50-65个氨基酸组成,特征是存在两个富含半胱氨酸-组氨酸残基的锌指,由疏汗结合(CX)分开2残雪17HX2C) - x2——(CX2残雪17残雪2C/H/D),如图1所示[38,41]。

图1所示。锌指的代表性方案,由两个富含半胱氨酸残基的区域组成,可与锌离子结合。这个结构由两个疏水氨基酸连接。

LIMD2蛋白的LIM结构域位于A或α链上,位于多肽的33-104残基之间,长度为72个氨基酸,分子量为8.32 kDa(图1B)[38]。LIMD2链A同时具有亲水和疏水区域,如图所示在网上分析(图2),这与适配器功能相关。A链含有最多的抗原区,由氨基酸序列(GFGRKQHQELWAHKEVDPGTK)组成,见表1和图3。

图2。在网上分析表明LIMD2三级结构的氨基酸位置及其疏水性。LIMD2同时表现出亲水和疏水区域,允许它与几种蛋白质相互作用。通过蛋白质数据库工具进行分析。

图3。基于剪接变体LIMD2-001的LIMD2抗原性分析显示,基于10 (HsID10)和50 (HsID50)氨基酸滑动窗口,基于9个氨基酸滑动窗口(抗原性)和蛋白间区域,与来自其他人类基因的其他蛋白质的最大序列一致性,产生免疫应答的倾向。数据基于人类蛋白质图谱。

LIM家族成员的蛋白质是非常混杂的。因此,LIMD2蛋白能够调节不同的细胞功能也就不足为奇了,如黏附、黏附连接、细胞增殖、细胞结构和运动[38]。因此,包括LIMD2在内的LIM蛋白在不同恶性肿瘤中普遍上调,如图4所示。此外,由于LIMD2能够解除对细胞黏附复合物的调控并诱导细胞运动,因此它与上皮-间充质转化(epithelial -mesenchymal transition, EMT)以及癌症转移[42]有关也就不足为奇了。

图4。LIMD2RNA在不同人类恶性肿瘤中的表达。数据来自人类蛋白质图谱。

根据系统发育研究,科赫,et al。[38]分析了265个蛋白质中的623个LIM结构域,根据14个超类的motif签名模式对它们进行聚类:ABLIM、CRP、ENIGMA、EPLIN、LASP、LIMK、LHX、LMO、LMO7、MICAL、PXN、PINCH、TES和ZYN。在这些超类中,EPLIN通过肌动蛋白纤维的再聚合来调节细胞运动,影响cadherin-catenin复合物的完整性[38]。由于LIMD2能够与细胞骨架相互作用,促进肌动蛋白聚合中断,该蛋白被归类为EPLIN超类[38]成员。

这种复合物的破坏是EMT的一个标志,也与癌症蒸汽细胞表型获得有关。

在此基础上,我们研究了原发性PTC和转移的成对石蜡包埋组织样本,证实了LIMD2在淋巴结转移中的差异表达,与原发性PTC和正常甲状腺相比,LIMD2未显示免疫检测[35,36]。我们还证实了ptc的转移与BRAFV600E是PTC中最常见的突变,与未突变的PTC转移相比,它显示LIMD2过表达BRAF[35]。

考虑到细胞培养是研究EMT的有用模型,我们从PTC显示的肿瘤甲状腺细胞系中研究了LIMD2的表达水平BRAFV600E突变(B-CPAP)和基因融合RET/PTC (TPC1),原发性滤泡性甲状腺癌(FTC133)和淋巴结转移相关的组织学肿瘤类型(FTC236)和正常人甲状腺(Nthy-ori 3-1)细胞系。这些分析结果表明LIMD2仅在B-CPAP和TPC1细胞系[43]中表达,进一步证实LIMD2的表达与PTC密切相关。彭也观察到了类似的数据,et al。[37],报告了TPC1细胞中的蛋白表达。

此外,还证实了LIMD2在软琼脂实验[37]中,敲低抑制迁移和入侵能力,并抑制菌落形成。相反,是LIMD2膀胱细胞异位表达导致细胞迁移和侵袭性增加[37]。这些数据得到了弗格森的证实,et al。[44]的研究表明,与膀胱原发肿瘤相比,LIMD2 RNA在淋巴结转移中的表达高出4.7倍。总之,这些数据表明LIMD2在甲状腺癌和膀胱癌的转移过程中起核心作用。

结论

尽管DTC有良好的预后,但约30%的患者有复发病史[5,6,10,15,45],10%的患者有最具侵袭性形式的疾病(PDTC和ATC)[32]的去分化。此外,甲状腺癌可以扩散到淋巴结和远处的器官。因此,研究调节甲状腺癌扩散的生物学机制是必须的,以确定原发肿瘤和转移之间差异表达的新基因。在这个意义上,LIMD2成为诊断和治疗的有用的生物技术靶点,因为该蛋白在PTC的转移中有差异表达,组织类型占所有甲状腺癌的90%。此外,基因表达与突变相关BRAFV600E,代表了这种恶性肿瘤中最常见的突变。因此,基于LIMD2的研究为甲状腺癌转移的研究开辟了新的领域。

确认

作者感谢Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP,资助号2014/06570-6和2017/14948-7)和Sociedade Brasileira de Endrocrinologia e metologia (SBEM,研究资助2018)。JMC是CNPq研究生产力奖学金的获得者。

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编辑信息

主编

Vita Golubovskaya博士
美国

文章类型

评论文章

出版的历史

收稿日期:2018年6月16日
录用日期:2018年7月15日
出版日期:2018年7月18日

版权

©2018 Araldi RP。这是一篇开放获取的文章,根据创作共用署名许可的条款发布,允许在任何媒介上不受限制地使用、分发和复制,前提是要注明原作者和来源。

引用

Arald RP, Cerutti JM(2018)基于LIMD2差异表达的甲状腺癌转移的新生物技术机会。肿瘤药物化学1:doi: 10.15761/TCRC.1000108。

相应的作者

Janete Maria Cerutti

巴西圣保罗佩德罗德托莱多街669号,圣保罗联邦大学遗传学部甲状腺肿瘤实验室遗传基础,形态学,圣保罗联邦大学,巴西圣保罗

表1。LIMD2剪接变体。LIMD2变体的氨基酸序列,以粗体显示抗原序列(GFGRKQHKELWAHKEVDPGTKT)。来源:Protein Atlas。

变体

UniProt

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图1所示。锌指的代表性方案,由两个富含半胱氨酸残基的区域组成,可与锌离子结合。这个结构由两个疏水氨基酸连接。

图2。在网上分析表明LIMD2三级结构的氨基酸位置及其疏水性。LIMD2同时表现出亲水和疏水区域,允许它与几种蛋白质相互作用。通过蛋白质数据库工具进行分析。

图3。基于剪接变体LIMD2-001的LIMD2抗原性分析显示,基于10 (HsID10)和50 (HsID50)氨基酸滑动窗口,基于9个氨基酸滑动窗口(抗原性)和蛋白间区域,与来自其他人类基因的其他蛋白质的最大序列一致性,产生免疫应答的倾向。数据基于人类蛋白质图谱。

图4。LIMD2RNA在不同人类恶性肿瘤中的表达。数据来自人类蛋白质图谱。