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轮状病毒胃肠炎，流动菌株，基因型，G6P [9]，牛轮状病毒，重配

RotaVirus（RV）是一种重要的病毒病原体，导致人类急性胃肠炎（年龄）。由于大多数婴儿已收到婴儿和幼儿的Rotavirus疫苗感染，此后发达国家的显着下降[1]。每年，疫苗阻止美国婴儿和幼儿中估计有40,000至50,000人住院治疗[2]。RV不仅感染人类，还有各种年轻的国内和野生动物，如猴子，牛，猪，马，狗，猫，老鼠，鸡肉和鸡和鹿[3-6]。虽然RV的性质在许多哺乳动物和鸟类中，人类RV感染的感染几乎限于人类。局域地区疫情的报道非常重要，可以从该地区的流行病中调查大流行。

RV是呼肠孤病毒科的一员，有11段双链RNA作为基因组，病毒颗粒由外衣壳、内衣壳和核心组成[7]在某些RV组中，外衣壳由两种结构蛋白VP4和VP7组成，其中含有中和抗原。内衣壳由结构蛋白VP6组成。根据内衣壳蛋白VP6的抗原性和基因组特征，RV分为七类（A–G），其中A组RV是人类和动物的主要病原。对于RV的流行病学调查，采用了基于外壳蛋白VP7（G型）和VP4（P型）的遗传分类系统[8]。

虽然已经从人体中分离了至少12克基因型，但G1，G2，G3，G4和新兴G9是人轮状病毒的主要基因型[3]。在人群中已零星检测到几种P基因型(P[1]-[3]、P[5]、P[7]、P[9]-[11]、P[14]、P[19]和P[25])[9-11]。作为人类p基因型，P [8]是全球最常见的基因型，其次是P [4]和P [6]。此外，已知6个非结构蛋白（NSP）[3]。在人RVS中，已经鉴定了五种常见的G和P基因型组合（基因组）：G1P [8]，G2P [4]，G3P [8]，G4P [8]和G9P [8]在WA样基因组星座上（I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1）和DS-1样星座上的G2P [4]（I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2））。Au-1样轮刺术构成第三组人RV，其分布在低流行率下，并具有不同的基因星座（G3-P [9] -i3-R3-C3-M3-A3-N3-T3-E3-H3）。

G6人轮状病毒虽然很少见，但却是牛源房车的主要病毒类型。在一项对日本奶牛的研究中，59.1%的分离株属于G6。第一株G6P[9]菌株PA151是从一名年龄为[12]的意大利儿童中分离出来的，其次是来自美国的Se584菌株[13]，几株来自匈牙利的[14]。G6P[9]随后在日本[15-17]、澳大利亚[18]和突尼斯[19]报道。通常情况下，牛G6菌株与P[5]、P[1]和世界范围内其他菌株[20]结合。

近年来，人们越来越多地对RV株全基因组序列进行分析，以了解人和动物RV的种间传播、重组和进化关系。在之前的研究[15,16]中，我们确定了所有基因片段的近全长序列，以研究在日本发现的唯一的人类G6P[9] rv的遗传起源。作者[21]认为他们的分离物代表了牛样人轮状病毒和人/猫au -1样轮状病毒之间的重组事件。G6在牛/水牛[22]、绵羊[23]和山羊中是一种常见的基因型[24,25]，在兔子和猪[26]中已零星发现或发病率较低。埃及G6P[14]和布基纳法索G6P[9]的[28]均为罕见病毒。最近在日本发现的唯一的人类G6P[9] rv的患者之前没有接触过明显的牛或其他感染源。

All other genes of the detected strain except for the NSP3 were relatively closely?related to at least one of the human G6 RVs reported in?Europe and the U.S. In a study from Miyagi Prefecture of Japan G6P [9] (M72S11) per sample was found from a 2-year-old toddler in 2011 [29]. Also G6P [9] have been detected from more than 3 cats of Mie Prefecture of Japan. These findings suggest that human G6 RV which had occurred by reassortment between human?and feline or bovine RV are distributed worldwide, despite low?prevalence. Since genotypes of a few gene segments are?different among those human G6 strains, this suggests that?G6 rotaviruses may occur independently in various locations or countries through reassortment among local strains.

尽管感染猫轮状病毒（FRV）很少会导致猫患严重疾病[30,31]，但FRV作为人类疾病的永久性来源（尽管不常见）引起了人们的注意。与FRV基因同源的人类RV已从广泛的地理位置分离出来，包括日本[32,33]、以色列[34]、突尼斯和美国[35]。此外，在意大利儿童中发现了假定的人/猫重配轮状病毒[36]。

两种G和P基因型鉴定在猫群中循环的轮状病毒携带的组合为G3P [9]和G6P [9]。G3P [9]和G6P [9]基因型已从人体中分离出来。G3P [9]是识别的猫科学基因型（Au-1样和Ba222样基因型星座[37]。在低普照中检测到发红rv（g6p [9]和g3p [9]）在英国的猫人口。G6是普及的基因型（84％），在苏格兰，中德兰和康沃尔郡检测到，这些地区是涵盖英国长度的地理上不同的地区[37]。这类似于估计来自包括日本在内的其他国家，但显示了区域和季节性变化。基于这种流行的纵向采样策略可用于更详细地调查传输动态。猫的RV感染与腹泻之间的关联与人类鲜明对比。

感染还与奶牛、乳猪和马的腹泻和生产力下降有关[38]。尽管由于缺乏以人群为基础的研究，对无症状感染在传播中的重要性尚不清楚，但仍有报道[39]。在奶牛中，无症状个体的病毒滴度与临床感染个体的病毒滴度相似，并且已假定RV的强毒株和无毒株的作用[40]。无症状感染可能反映了G6P[9]和G3P[9]与猫宿主关系的性质[41]。

已经提出了在某些历史点的G6猫型起源的可能性。随着发表的人G6基因型与我们的猫科动物G6基因型，而不是出版的牛G6基因型[42]，强烈表明G6P [9]基因型是猫和族之间的人畜共患病或蒽吞并生传播的实例。

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G6P[9]是一种比较常见的猫轮状病毒，在日本猫群中发病率较低。猫或牛与人之间可能存在传播事件，尽管它们不常见，也不会导致疾病暴发。家庭宠物中RV的监测对于调查轮状病毒的遗传多样性、阐明无症状携带的作用、探索人畜共患风险以及监测非人类轮状病毒在RV进化中的潜在作用具有重要意义。

的利益冲突

没有商业关系或潜在的利益冲突相关的提交本手稿。

工具书类

1. Steele Ad，Cunliffe n，Tumbo J，Madhi Sa，De Vos B等。（2009）对人免疫缺陷病毒感染儿童的RotaVirus感染和疫苗接种综述。感染性疾病杂志200(增刊1):57-62。［Crossref］
2. Numazaki K（2016）日本轮状病毒疫苗前后轮状病毒感染的特征。aperito j感染疫苗2:保护主义。
3. 埃斯特斯·姆克，格林伯格HB（2013）《轮状病毒》，载于：菲尔兹BN，Knipe DM，霍利PM（编辑）菲尔兹病毒学，利平科特，威廉姆斯和威尔金斯，费城，1347-1401。
4. Ghosh S，Kobayashi n（2014）在异国动物的动物和轮状病毒中的异国情调的轮状病毒。病毒Disease.25：158-172。[crossref]
5. Santos N，Hoshino Y（2005）全球旋转病毒血清型/基因型的分布及其对开发和实施有效轮状病毒疫苗的含义。Rev Med Virol.15：29-56。[crossref]
6. Martella V, Bányai K, Matthijnssens J, Buonavoglia C, Ciarlet M(2010)轮状病毒的人畜共患方面。兽医微生物学140: 246-255.[crossref]
7. Gentsch JR，Laird A R，Bielfelt B，Griffin DD，Banyai K等（2005）人类和动物轮状病毒株之间的血清型多样性和重配：对轮状病毒疫苗计划的影响。感染性疾病杂志192（补充1）：S146-S159[Crossref］
8. Matthijnssens J，Ciarlet M，McDonald SM，Attoui H，BányaiK，等。（2011）轮状病毒分类工作组（RCWG）提出的RotaVirus菌株命名的均匀性。阿奇维罗156(8): 1397 - 1413。［Crossref］
9. Mandal P，Mullick S，Nayak Mk，Mukherjee A，Ganguly N等人。（2016）完整的异常物种的基因分型rotavirus g12p [11]和G10p [14]分离和频繁在2014年Kolkata腹泻检测到腹泻儿童中的腐败中的体内重新排列的频率。阿奇维罗161：2773-2785。［Crossref］
10. Steyer A，NagliÄT，Jamnikar CigleneÄki U，Kuhar U（2017）从腹泻患儿分离的人畜共患病G8P[14]轮状病毒株的检测和全基因组分析。基因组公告5。[crossref]
11. Delogu R, Lo Presti A, Ruggeri FM, Cella E, Giovanetti M，等(2013)2006年克罗地亚腹泻儿童中出现的一种G8P[8]轮状病毒的全基因组特征。中国Microbiol51：1583-1588。［Crossref］
12. Gerna G, Sarasini A, Parea M, Arista S, Miranda P, et al.(1992)两种具有G6特异性的人轮状病毒株的分离和鉴定。中国Microbiol30：9-16。[crossref]
13. Griffin DD，Nakagomi T，Hoshino Y，Nakagomi O，Kirkwood CD，等。（2002）国家轮状病毒监测系统。来自美国的无卵形轮状病毒菌株的表征：鉴定与牛旋转血管有关的新轮状病毒重新分配（P2A [6]，G12）和罕见的P3 [9]菌株。virol.294：256-269。［Crossref］
14. Bányai K, Gentsch JR, Griffin DD, Holmes JL, Glass RI，等(2003)G6血清型人类轮状病毒的遗传变异:在匈牙利分离的一个新谱系的鉴定。J Med Virol.71：124-134。［Crossref］
15. Yamamoto D，Kawaguchiya M，Ghosh S，Ichikawa M，Numazaki K，等。（2011）日本G6P [9]人类轮状病毒的检测与全基因组分析。病毒基因43：215-223。[crossref]
16. Numazaki K，Iichikawa M（2014）RotaVirus胃肠炎的临床和病毒学特征以及托奇尼，日本毒素患病率。体内28:1141-1147. [Crossref］
17. Cooney Ma，Gorrell RJ，Palombo EA（2001）血清型G6和G8人轮状病毒VP7蛋白的表征和系统发育分析。医学微生物学杂志50：462-467。［Crossref］
18. Diwakarla S，Clark R，Palombo EA（2002）扩大澳大利亚人类血清型G6轮状病毒的分布。微生物学免疫46：499-502。[crossref]
19. Ben Hadj Fredj M, Heylen E, Zeller M, Fodha I, Benhamida-Rebai M，等(2013)轮状病毒毒株的猫科来源，突尼斯，2008。急诊感染19：630-634。[crossref]
20. jamnikar-ciglenecki u，Kuhar U，Sturm S，Kirbis A，Racki N等人。（2016）G6P [15]从Roe鹿的RotaVirus菌株组的第一次检测和全基因组特征。兽医微生物学191: 52-59.[crossref]
21. Numazaki K，Ichikawa M（2017）研究了日本枥木枥区枥木地区儿童检测到的牛轮状病毒菌素的起源。中国传染病和流行病学杂志CHINESE3：1-8。
22. Chang Ko，Parwani AV，SAIF LJ（2000）G6，G8和G10牛G10牛族基因的比较序列分析，以及G6亚型的进一步表征。阿奇维罗145: 725-737. [Crossref］
23. Fitzgerald TA，Munoz M，Wood AR，Snodgrass DR（1995）羔羊A组轮状病毒的血清学和基因组特征。阿奇维罗140: 1541-1548.[crossref]
24. Ghosh S，Alam MM，Ahmed MU，Talukdar RI，Paul SK等。（2010）山羊a组轮状病毒株的完整基因组星座揭示了反刍动物和人类轮状病毒株的共同进化。J创性研究91：2367-2373。［Crossref］
25. Pratelli A，Martella v，Tempesta M，Buonavoglia C（1999）特征在意大利分离的反刍动物旋塞术聚合酶链反应的特征。microbiologica.22：105-109。［Crossref］
26. 古维亚V，桑santos N, Timenetsky Mdo C(1994)牛和猪轮状病毒G型的PCR鉴定。中国Microbiol32：1338-1340。[crossref]
27. El Sherif M，Esona MD，Wang Y，Gentsch Jr，Jiang B等。（2011）检测来自埃及腹泻的儿童的第一个G6P [14]人类轮状病毒菌质。感染遗传evol.11: 1436 - 1442。[crossref]
28. Nordgren J，Nitiema LW，Sharma S，Ouermi D，Traore As等。（2012）出现不寻常的G6P [6]罗出血病，Burkina Faso，2009-2010。急诊感染18: 589 - 597。[crossref]
29. 传染源监测报告IASR，国家传染病研究所（日本国立传染病研究所，第35卷，第298-300页：2014年）（日文）
30. Hoshino Y, Baldwin CA, Scott FW(1981)猫轮状病毒的分离与鉴定。J创性研究54: 313-323.[crossref]
31. Mochizuki M，Nakagomi T，Nakagomi O（1997）从三个轮状病毒菌株的腹泻和无症状的分离，其属于人类轮状病毒的Au-1种族小组。中国Microbiol35: 1272-1275. [Crossref］
32. Nakagomi O, Nakagomi T, Oyamada H, Suto T(1985)人轮状病毒亚群1和2在日本儿童急性肠胃炎中的相对频率。J Med Virol.17：29-34。[crossref]
33. Nakagomi T, Nakagomi O (1989) RNA-RNA杂交鉴定出一种与猫轮状病毒遗传相关的人类轮状病毒。J Virol.63: 1431-1434.[crossref]
34. Aboudy Y, Shif I, Zilberstein I, Gotlieb-Stematsky T(1988)利用多克隆抗体和单克隆抗体及病毒RNA分析检测不寻常的A组人轮状病毒。J Med Virol.25：351-359。[crossref]
35. Nakagomi T，Nakagomi O（2000）人类轮状病毒HCR3拥有基因组RNA星座，与猫科动物和犬旋转毒脉无法区分。阿奇维罗145: 2403 - 2409。［Crossref］
36. De Grazia S, Giammanco GM, Martella V, Ramirez S, Colomba C, et al.(2008)在意大利腹泻儿童中检测到罕见的au -1样G3P[9]人类轮状病毒，带有kunlike NSP4基因。中国Microbiol46：357-360。[crossref]
37. Nakagomi O，Ohshima A，Aboudy Y，Shif I，Mochizuki M，等。（1990）人类轮状病毒的RNA-RNA杂交的分子鉴定，与猫的旋转痉挛密切相关。中国Microbiol28日:1198 - 1203。［Crossref］
38. Dhama K, Chauhan RS, Mahendran M, Malik SV(2009)牛和其他家畜的轮状病毒腹泻。兽医Res Commun33: 1-23.[crossref]
39. Mukhopadhya I、Sarkar R、Menon VK、Babji S、Paul A等（2013）使用逆转录定量PCR在有症状和无症状儿童中的轮状病毒脱落。J Med Virol.85: 1661-1668. [Crossref］
40. Bridger JC, Oldham G(1987)无毒性轮状病毒感染可通过诱导高水平中和抗体保护犊牛免受疾病侵袭。J创性研究68：2311-2317。［Crossref］
41. 德国AC，Iturriza-gómaraM，鸽子W，SandraseGaram M，Nakagomi T，等。（2015）英国猫的旋转血清的分子流行病学。中国Microbiol53: 455-464.
42. Kalica AR、Greenberg HB、Wyatt RG、Flores J、Sereno MM等（1981）编码中和和亚群抗原的人类（Wa株）和牛（UK株）轮状病毒基因。病毒学112: 385-390.