关键词
轮状病毒胃肠炎,流动菌株,基因型,G6P [9],牛轮状病毒,重配
RotaVirus(RV)是一种重要的病毒病原体,导致人类急性胃肠炎(年龄)。由于大多数婴儿已收到婴儿和幼儿的Rotavirus疫苗感染,此后发达国家的显着下降[1]。每年,疫苗阻止美国婴儿和幼儿中估计有40,000至50,000人住院治疗[2]。RV不仅感染人类,还有各种年轻的国内和野生动物,如猴子,牛,猪,马,狗,猫,老鼠,鸡肉和鸡和鹿[3-6]。虽然RV的性质在许多哺乳动物和鸟类中,人类RV感染的感染几乎限于人类。局域地区疫情的报道非常重要,可以从该地区的流行病中调查大流行。
RV是呼肠孤病毒科的一员,有11段双链RNA作为基因组,病毒颗粒由外衣壳、内衣壳和核心组成[7]在某些RV组中,外衣壳由两种结构蛋白VP4和VP7组成,其中含有中和抗原。内衣壳由结构蛋白VP6组成。根据内衣壳蛋白VP6的抗原性和基因组特征,RV分为七类(A–G),其中A组RV是人类和动物的主要病原。对于RV的流行病学调查,采用了基于外壳蛋白VP7(G型)和VP4(P型)的遗传分类系统[8]。
虽然已经从人体中分离了至少12克基因型,但G1,G2,G3,G4和新兴G9是人轮状病毒的主要基因型[3]。在人群中已零星检测到几种P基因型(P[1]-[3]、P[5]、P[7]、P[9]-[11]、P[14]、P[19]和P[25])[9-11]。作为人类p基因型,P [8]是全球最常见的基因型,其次是P [4]和P [6]。此外,已知6个非结构蛋白(NSP)[3]。在人RVS中,已经鉴定了五种常见的G和P基因型组合(基因组):G1P [8],G2P [4],G3P [8],G4P [8]和G9P [8]在WA样基因组星座上(I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1)和DS-1样星座上的G2P [4](I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2))。Au-1样轮刺术构成第三组人RV,其分布在低流行率下,并具有不同的基因星座(G3-P [9] -i3-R3-C3-M3-A3-N3-T3-E3-H3)。
G6人轮状病毒虽然很少见,但却是牛源房车的主要病毒类型。在一项对日本奶牛的研究中,59.1%的分离株属于G6。第一株G6P[9]菌株PA151是从一名年龄为[12]的意大利儿童中分离出来的,其次是来自美国的Se584菌株[13],几株来自匈牙利的[14]。G6P[9]随后在日本[15-17]、澳大利亚[18]和突尼斯[19]报道。通常情况下,牛G6菌株与P[5]、P[1]和世界范围内其他菌株[20]结合。
近年来,人们越来越多地对RV株全基因组序列进行分析,以了解人和动物RV的种间传播、重组和进化关系。在之前的研究[15,16]中,我们确定了所有基因片段的近全长序列,以研究在日本发现的唯一的人类G6P[9] rv的遗传起源。作者[21]认为他们的分离物代表了牛样人轮状病毒和人/猫au -1样轮状病毒之间的重组事件。G6在牛/水牛[22]、绵羊[23]和山羊中是一种常见的基因型[24,25],在兔子和猪[26]中已零星发现或发病率较低。埃及G6P[14]和布基纳法索G6P[9]的[28]均为罕见病毒。最近在日本发现的唯一的人类G6P[9] rv的患者之前没有接触过明显的牛或其他感染源。
All other genes of the detected strain except for the NSP3 were relatively closely?related to at least one of the human G6 RVs reported in?Europe and the U.S. In a study from Miyagi Prefecture of Japan G6P [9] (M72S11) per sample was found from a 2-year-old toddler in 2011 [29]. Also G6P [9] have been detected from more than 3 cats of Mie Prefecture of Japan. These findings suggest that human G6 RV which had occurred by reassortment between human?and feline or bovine RV are distributed worldwide, despite low?prevalence. Since genotypes of a few gene segments are?different among those human G6 strains, this suggests that?G6 rotaviruses may occur independently in various locations or countries through reassortment among local strains.
尽管感染猫轮状病毒(FRV)很少会导致猫患严重疾病[30,31],但FRV作为人类疾病的永久性来源(尽管不常见)引起了人们的注意。与FRV基因同源的人类RV已从广泛的地理位置分离出来,包括日本[32,33]、以色列[34]、突尼斯和美国[35]。此外,在意大利儿童中发现了假定的人/猫重配轮状病毒[36]。
两种G和P基因型鉴定在猫群中循环的轮状病毒携带的组合为G3P [9]和G6P [9]。G3P [9]和G6P [9]基因型已从人体中分离出来。G3P [9]是识别的猫科学基因型(Au-1样和Ba222样基因型星座[37]。在低普照中检测到发红rv(g6p [9]和g3p [9])在英国的猫人口。G6是普及的基因型(84%),在苏格兰,中德兰和康沃尔郡检测到,这些地区是涵盖英国长度的地理上不同的地区[37]。这类似于估计来自包括日本在内的其他国家,但显示了区域和季节性变化。基于这种流行的纵向采样策略可用于更详细地调查传输动态。猫的RV感染与腹泻之间的关联与人类鲜明对比。
感染还与奶牛、乳猪和马的腹泻和生产力下降有关[38]。尽管由于缺乏以人群为基础的研究,对无症状感染在传播中的重要性尚不清楚,但仍有报道[39]。在奶牛中,无症状个体的病毒滴度与临床感染个体的病毒滴度相似,并且已假定RV的强毒株和无毒株的作用[40]。无症状感染可能反映了G6P[9]和G3P[9]与猫宿主关系的性质[41]。
已经提出了在某些历史点的G6猫型起源的可能性。随着发表的人G6基因型与我们的猫科动物G6基因型,而不是出版的牛G6基因型[42],强烈表明G6P [9]基因型是猫和族之间的人畜共患病或蒽吞并生传播的实例。
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G6P[9]是一种比较常见的猫轮状病毒,在日本猫群中发病率较低。猫或牛与人之间可能存在传播事件,尽管它们不常见,也不会导致疾病暴发。家庭宠物中RV的监测对于调查轮状病毒的遗传多样性、阐明无症状携带的作用、探索人畜共患风险以及监测非人类轮状病毒在RV进化中的潜在作用具有重要意义。
的利益冲突
没有商业关系或潜在的利益冲突相关的提交本手稿。
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