细胞表面蛋白的光谱(表面组)是制药行业的重点之一,因为在药物库数据库中注册的66%的已批准的人类药物都是针对细胞表面的蛋白质,这使得表面组具有重要的治疗意义[1]。然而,对人体表面蛋白库的全面评估仍然是一个主要挑战,需要几种方法来检查细胞表面蛋白,特别是在可用细胞数量较少的情况下。
通过下一代大体积rna测序和单细胞rna测序的深度测序进行基因表达分析,结合蛋白质组学的细胞表面蛋白表达,有可能克服对人类细胞表面基因的不准确预测。这种方法可以避免依赖于mRNA水平和有效蛋白质表达之间的假设相关性,并定义细胞蛋白质组,包括位于细胞表面的蛋白质。
目前,最先进的基于ngs的转录组学技术专注于单个细胞的分析,并允许对罕见细胞类型或细胞亚群[2]的表面标记进行表征。此外,在过去的几年里,蛋白质组学方法已经提高了它们的灵敏度,这导致质谱应用[1]的实质性改进。
最后,这种方法可以构成一种系统的靶点发现方法,以设计新的癌症靶向治疗方法,在免疫治疗和工程细胞治疗领域尤其有用。
免疫细胞疗法在包括血液系统恶性肿瘤在内的几种癌症中取得了惊人的进展,包括工程T细胞受体(TCR)、肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)、细胞毒性T淋巴细胞(ctl)、自然杀伤细胞(NK)和嵌合抗原受体(CAR)-T细胞,以及其他[3]。重要的是,细胞疗法治疗患者的成功取决于抗原的选择,理想的抗原应该是在靶向癌细胞[4]中均匀且强烈表达的细胞表面蛋白。其他方法,如多肽疫苗,利用恶性胶质瘤[5]体内表达的细胞表面抗原,提供了安全性和免疫原性的概念证明。类似地,完整的肿瘤抗原库的特征可以提供更有效的个体化疫苗免疫治疗,正如胶质瘤积极个体化疫苗联盟(GAPVAC)[6]所显示的那样。
此外,主要的挑战之一是肿瘤间和肿瘤内的异质性,因为抗原在患有同一肿瘤的不同患者之间是高度异质性的,并不是所有的肿瘤细胞都统一表达相同的表面抗原。与靶向癌细胞一起,可以通过抑制肿瘤微环境的细胞,如促肿瘤巨噬细胞[7],来设想多靶向方法。
总之,我们不应低估靶点发现阶段的重要性,它是为新的靶向治疗选择良好的抗原、减少副作用和最大化抗肿瘤疗效的关键步骤。在这方面,广泛的临床前研究结合跨生物信息学和细胞生物学/细胞工程对所选抗原的跨学科方法是必要的。
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编辑信息
主编
特里Lichtor
Tsuyoshi Hirata
Shinya美津浓
Giacomo柯拉
文章类型
编辑
出版的历史
收稿日期:2020年4月3日
录用日期:2020年4月16日
发布日期:2020年4月20日
版权
©2020 Marinari E.这是一篇根据创作共用署名许可条款发布的开放获取文章,允许在任何媒介上不受限制地使用、分发和复制,前提是注明原作者和来源。
引用
Eliana Marinari和Denis Migliorini(2020)表面组分析在癌症中设计新型靶向治疗的力量。翻译科学7:DOI: 10.15761/JTS.1000383。
相应的作者
Denis Migliorini教授
瑞士日内瓦大学医院肿瘤科,瑞士癌症中心Léman和瑞士洛桑ISREC基金会
电子邮件:bhuvaneswari.bibleraaj@uhsm.nhs.uk